2024-12-30 03:00:00
جمع البيانات وتفسير السياق
بدءًا من الظروف الجغرافية، تم تجميع المشاركين من مناطق متعددة في اليمن، حيث أجريت عمليات استخراج الحمض النووي من 3 مل من الدم في جامعة صنعاء. تمت مراعاة المبادئ الأخلاقية وفقًا لإعلان هلسنكي، وتم الحصول على موافقة مسبقة من جميع المتطوعين للمشاركة في الدراسة.
الخرائط والأدوات
توضح الخريطة الموضوعة مناطق الجمهورية اليمنية، مع تحديد مواقع أخذ العينات باستخدام مثلثات مقاسة، تم إعداد هذه الخريطة باستخدام المكتبات البرمجية بايثون، مما يعكس الجهود المبذولة لجمع البيانات المتنوعة.
تحليل البيانات الجينية
تم الحصول على بيانات الجينوم لأشخاص من جميع المحافظات باستخدام تقنية الـ Illumina HumanOmni2.5-8 BeadChip، التي تحتوي على أكثر من مليوني نقطة تحليل وراثي. وقد تم إجراء عمليات التوصيف الجيني في معهد ويلكوم سانجر في المملكة المتحدة، حيث تم استعراض البيانات المجمعة، بما في ذلك معلومات حول موقع أخذ العينات والنظائر الجغرافية الأخرى.
السياقات التاريخية
لإثراء التحليل، تم استخدام مجموعات بيانات شاملة كمرجع، بما في ذلك موارد الحمض النووي القديمة وأبحاث التنوع الجيني البشري، وهو ما ساعد في توفير رؤية أوسع حول الهجرة البشرية من منطقة الشام وشبه الجزيرة العربية إلى اليمن منذ ذروة العصر الجليدي الأخير.
استراتيجيات التحليل الجيني
استخدمت أدوات تحليلية مثل Plink لتحويل البيانات والمزج بينها، مما ساعد على الحفاظ على نقاط التحليل المهمة مع تقليل البيانات المفقودة من العينات المختارة. تم إجراء تحليلات الإختلاط باستخدام أدوات ADMIXTURE، مع قياس الأخطاء عبر نماذج مختلفة لتحديد عدد السكان.
تحليل المكونات الرئيسية
تم تحويل البيانات إلى تنسيق EIGENSTRAT، واستخدام التحليل الذكي لحساب مكونات البيانات الرئيسية، مع استبعاد العينات القديمة من التحليل. استندت النتائج إلى تحليل كثافة النواة لتوفير رؤى حول الروابط الجينية.
إحصائيات F
تم استخدام مكتبة Admixtools لحساب إحصائيات F، لتحديد تباين السكان باستخدام تقديرات هودسون، والتي توفر معلومات قيّمة حول الهجرات والتداخلات الجينية على مدار الزمن.
التدفق الجيني والميراث
مع تقدم الأبحاث، تم تحديد أنماط هجرة القرى والمحافظات، مع تحليل رسومي لنتائج الدراسات البيانية التي تتناول التدفق الجيني ووراثة الأنساب، مما يساعد على فهم كيفية تفاعل اليمن مع مناطق أخرى.
هيكلية دقيقة
تم استخدام برنامج FineSTRUCTURE لاستكشاف الفروق الجينية بين المجموعات المختلفة في اليمن، ومع مقارنة هذه الفروق مع البيانات الإقليمية، تم تقديم النتائج عبر أشجار الهيكلية الدقيقة.
تحليل الجينوم الكامل
بالإضافة إلى تحليل الجينات، تم إجراء تسلسل الجينوم الكامل لـ 46 عينة بتعمق أكثر من 30 مرة، مما سمح بجمع بيانات تفصيلية حول التنوع الجيني واكتشاف نقاط التحليل الجيني الجديدة.
دراسة تسلسل الحمض النووي النووي
تم تحليل مجموعات الحمض النووي الميتوكوندري، حيث تم تحديد الأنماط الجينية المرتبطة بالحمض النووي، مما أسفر عن رؤى حول النسب الوراثية والسلالات المختلفة.
تحليل الحمض النووي Y
تضمن التحليل النهائي تصنيف الأنماط الجينية المرتبطة بالكروموسوم Y، مما يعزز الفهم حول الوراثة الذكورية والتوزيع الجغرافي للكروموسومات بين مجموعات السكان.
تدهور ارتباط التحليل الجيني
استخدمت أدوات متقدمة لتحليل تدهور الارتباط، مع نتائج توضح الأحداث التاريخية المتعددة للهجرات وتأثيرها على التركيب الجيني للسكان اليمنيين عبر الزمن.
